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Guía de selección de kits para extracción de ADN plasmídico


Descripción general de la extracción de ADN plasmídico

La extracción de ADN plasmídico se diferencia de la purificación de ADN genómico en un aspecto importante: la selección del producto depende menos del tipo de muestra y más de los requisitos del flujo de trabajo posterior. En la mayoría de los laboratorios, las preguntas clave son si se requiere ADN plasmídico de baja endotoxina, qué volumen de cultivo bacteriano debe procesarse y si el flujo de trabajo corresponde a una preparación manual rutinaria, un formato paralelo de 96 pocillos o un procesamiento orientado a automatización.

Magen ofrece una cartera estructurada de extracción de ADN plasmídico basada tanto en tecnologías de columna de sílice como de perlas magnéticas. Dentro de este sistema, la línea estándar de plásmidos respalda flujos de trabajo rutinarios de clonación, PCR, digestión con enzimas de restricción y secuenciación, mientras que la línea de baja endotoxina está diseñada para aplicaciones que requieren preparaciones plasmídicas más limpias, incluidos flujos orientados a transfección y, en la ruta EF maxi actualizada, aplicaciones posteriores más exigentes. La cartera también cubre formatos mini, midi, maxi, mega y de 96 pocillos, lo que permite escalar desde el cribado plasmídico rutinario hasta preparaciones de mayor lote sin cambiar a un sistema químico no relacionado.

Dentro del sistema actual de plásmidos de Magen, HiPure Plasmid Mini Kit (P1001) funciona como modelo de referencia de columna estándar para la preparación plasmídica rutinaria, mientras que HiPure Plasmid EF Maxi Kit B (P1156B) actúa como producto principal de referencia en columna de baja endotoxina para flujos EF de mayor escala y mayor exigencia. Otros productos de la serie amplían este sistema hacia mayor escala, procesamiento de 96 pocillos, manejo magnético o configuraciones EF anteriores.


Guía rápida de selección

1. Empiece por el requisito de endotoxinas

Para clonación rutinaria, PCR, digestión con enzimas de restricción y secuenciación estándar, los sistemas plasmídicos estándar suelen ser suficientes.

Para flujos orientados a transfección o de mayor pureza, los sistemas plasmídicos de baja endotoxina son más apropiados.

2. Después seleccione según la escala

Mini: preparación rutinaria de pequeño volumen

Midi / Maxi / Mega: mayor volumen de cultivo y mayor cantidad total de plásmido

96 pocillos: cribado paralelo y preparación por lotes

Perlas magnéticas: flujos de trabajo orientados a automatización

3. La diferencia entre plásmidos de alto y bajo número de copias es importante

Los plásmidos de bajo número de copias suelen requerir mayor entrada de cultivo para alcanzar un rendimiento total útil. Los plásmidos de alto número de copias a menudo alcanzan rendimientos útiles con menor entrada, pero las columnas más pequeñas pueden llegar antes a su capacidad de unión.

4. Selección práctica

Para la preparación plasmídica estándar rutinaria, comience con P1001 or P1002.

Para preparación rutinaria con clarificación más rápida y mayor entrada de cultivo, pase a P1013 or P1014.

Para plásmidos de bajo número de copias en flujos de pequeña escala de baja endotoxina consulte P1154.

Para medium- to plásmidos de bajo número de copias en preparación a gran escala de baja endotoxina P1156B es el principal producto de referencia.

Para plásmidos de mayor número de copias en preparación de escala media de baja endotoxina cuando se requiera una salida concentrada, consulte P1231.

Para muy alto rendimiento de baja endotoxina a partir de alto número de copias plásmidos, refer to P1116.

Para flujos de alto rendimiento de 96 pocillos utilice P1006 or P1157.

Para manejo orientado a automatización utilice P1811 or P1814.


Contextos comunes de plásmidos

Plásmido número de copias is determined mainly by vector backbone rather than host strain alone. In practical flujo de trabajo selection, plásmidos de mayor número de copias usually reach useful yield at lower entrada de cultivo, while lower-copy plásmidos often require larger volumen de cultivo to achieve the same output.

l Plásmidos típicos de mayor número de copias

  • plásmidos derivados de pUC
  • plásmidos tipo pBluescript
  • vectores de clonación tipo pGEM
  • plásmidos pequeños de clonación rutinaria
  • muchos plásmidos de expresión estándar con esqueletos de alto número de copias, como plásmidos comunes tipo pcADN en flujos de preparación rutinaria

l Plásmidos típicos de menor número de copias

  • vectores BAC
  • vectores fosmid
  • cósmidos
  • plásmidos grandes de más de 10 kb
  • plásmidos lentivirales y otros constructos funcionales grandes

l Notas sobre medios de cultivo

  • LB es el medio inicial estándar para la mayoría de los flujos de preparación plasmídica.
  • Los medios más ricos, como 2×YT, YT o TB, pueden aumentar la biomasa y el rendimiento total de plásmido, pero también pueden incrementar el riesgo de sobrecargar columnas pequeñas.
  • Para larger de baja endotoxina flujo de trabajos, input is better judged by OD600 × volumen de cultivo together with expected plásmido número de copias.


Comparación técnica de los kits de ADN plasmídico de Magen

Producto Tecnología Grado de pureza Recomendado
Entrada de cultivo recomendada*
Estrategia clave Uso recomendado
HiPure Plasmid Mini Kit
(P1001)

Columna de centrifugación Estándar 1–5 mL Rutinario alkaline lysis and silica column purificación for standard manual plásmido a partir de small volumen de cultivos Rutinario clonación plásmidos and other standard plásmido vectors for clonación, PCR, digestión con enzimas de restricción and secuenciación.
HiPure Plasmid Mini Kit II
(P1002)
Columna de centrifugación Estándar 5–15 mL Flujo mini-prep de mayor entrada basado en la misma química de columna estándar utilizada en la purificación plasmídica rutinaria Vectores plasmídicos estándar cuando se necesita mayor entrada de cultivo dentro de un flujo mini-prep rutinario.
HiPure Plasmid Plus 96 Kit
(P1006)
Placa de columnas de 96 pocillos Estándar
1.5 mL
por pocillo
Flujo de placa de columnas de 96 pocillos para purificación plasmídica paralela en cribado por lotes y manejo de múltiples muestras Vectores plasmídicos estándar en flujos de cribado de alto rendimiento y preparación de múltiples muestras.
HiPure FastFilter Plasmid Midi Kit
(P1013)
Columna de centrifugación + FastFilter Estándar 30–50 mL Purificación en columna de escala media con eliminación rápida de restos de lisado asistida por filtro antes de la unión del ADN Mid-scale standard plásmido preparación when clarificación más rápida clarification and more efficient manual handling are preferred.
HiPure FastFilter Plasmid Maxi Kit
(P1014)
Columna de centrifugación + FastFilter Estándar 200 mL Purificación en columna a gran escala con eliminación rápida de restos de lisado asistida por filtro antes de la unión del ADN Large-scale standard plásmido preparación when clarificación más rápida clarification and higher entrada de cultivo handling are required.

HiPure Plasmid EF Mini Kit
(P1154)
Columna de centrifugación Baja endotoxina 5–15 mL High-salt selective de baja endotoxina mini-prep flujo de trabajo with a defined column loading boundary and reduced ARN interference Medium- to plásmidos de bajo número de copias, small-scale de baja endotoxina and flujo de trabajos requiring more accurate OD-based plásmido quantification with reduced ARN interference.
HiPure Plasmid EF Midi Kit
(P1231)
Columna de centrifugación Baja endotoxina 25–50 mL Precipitación selectiva combinada con un formato compacto de columna con extensor para preparación de escala media y recuperación concentrada de plásmido Plásmidos de mayor número de copias requiring mid-scale de baja endotoxina preparación with small elution volume and alta concentración plasmídica.
HiPure Plasmid EF Maxi Kit B
(P1156B)
Columna de centrifugación Baja endotoxina 100–200 mL Upgraded de baja endotoxina maxi flujo de trabajo with improved endotoxina removal and ARN control for more demanding downstream applications Broad plásmido vector compatibility, particularly for medium- to plásmidos de bajo número de copias, in transfección, inyección y flujos avanzados in vitro.
HiPure Plasmid EF Mega Kit
(P1116)
Columna de centrifugación Baja endotoxina ~500 mL Ultra-high-binding plásmido enrichment combined with large-format column purificación for very high-yield a partir de alto número de copias plásmidos Plásmidos de alto número de copias que requieren una producción total muy alta; not recommended for medium- to plásmidos de bajo número de copias, larger constructs above 10 kb, or lentiviral vectors
HiPure Plasmid EF 96 Kit
(P1157)
Placa de columnas de 96 pocillos Baja endotoxina
1.3–1.5 mL
por pocillo
96-well de baja endotoxina plate flujo de trabajo for parallel plásmido preparación in screening and batch processing formats Medium- to plásmidos de bajo número de copias in high-throughput de baja endotoxina screening and batch preparación flujo de trabajos, especially when cleaner parallel preparación is preferred.

MagPure Plasmid Mini Kit
(P1811)
Perlas magnéticas Estándar 1-3 mL Magnetic bead-based high-throughput plásmido purificación for batch handling, deep-well processing and manejo orientado a automatización flujo de trabajos, with PW1 washing used to control ARN carryover when needed Automated or batch plásmido preparación for both alto número de copias and plásmidos de bajo número de copias, especially in high-throughput flujo de trabajos where magnetic handling is preferred
MagPure Plasmid EF Mini Kit
(P1814)
Perlas magnéticas Baja endotoxina 1-3 mL High-salt–mediated magnetic bead-based de baja endotoxina plásmido purificación with reduced ARN interference in automation-compatible flujo de trabajos Medium- to bajo número de copias plásmidos in automated de baja endotoxina preparación and batch or plate-based flujo de trabajos, especially when reduced ARN interference is important

Para especificaciones detalladas y descripciones de flujo de trabajo, consulte las páginas de producto correspondientes.

*Nota: La entrada de cultivo recomendada debe interpretarse junto con la composición del medio, la densidad del cultivo y el número de copias del plásmido, y no solo en función del volumen de cultivo. Los medios más ricos, como 2×YT, YT o TB pueden producir más biomasa que LB, lo que puede aumentar la carga plasmídica real aplicada al sistema de purificación. En la práctica, la entrada de cultivo se evalúa mejor junto con OD600 and expected plásmido yield per mL culture, especially in larger-scale or de baja endotoxina flujo de trabajos.

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