Detalles
Especificaciones
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Características
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Especificaciones
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Funciones principales
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Recuperación selectiva de ADN a partir de productos de PCR y soluciones de reacciones enzimáticas (alternativa a Beckman Coulter Agencourt AMPure XP)
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Aplicaciones
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NGS y preparación de bibliotecas de ADN
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Tecnología de purificación
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Tecnología de perlas magnéticas
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Método de procesamiento
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Manual o automatizado
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Tipo de muestra
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Productos de ADN, mezclas de digestión con endonucleasas de restricción y otras soluciones de reacciones enzimáticas
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Cantidad de muestra
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Según la aplicación
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Recuperación
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80 %
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Tiempo de procesamiento
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≤50 minutos
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Principio
Este producto utiliza partículas magnéticas de alta capacidad de unión para la purificación de ADN. Al mezclar los amplicones de PCR con MagPure A4 XP, los fragmentos de ADN de 100 pb o más se unen a las perlas magnéticas. Los cebadores sobrantes, los nucleótidos, las sales y las enzimas se eliminan mediante un sencillo procedimiento de lavado. Finalmente, el ADN se eluye con tampón de elución o agua.
Validación técnica
MagPure A4 XP se evaluó mediante ensayos internos de control de calidad para la selección de fragmentos de ADN por tamaño, la recuperación de marcadores de ADN a microescala y la evaluación del fondo de ácidos nucleicos. El lote de A4 XP analizado se comparó con un lote de control estándar utilizando diferentes relaciones entre el volumen de perlas y el de muestra.
En los ensayos de selección por tamaño de marcadores de ADN a macroescala, MagPure A4 XP mostró patrones de recuperación de fragmentos dependientes de la proporción de perlas, desde 0,6× hasta 1,8×. El análisis mediante electroforesis en gel de agarosa no mostró diferencias evidentes entre el lote evaluado y el lote de control, lo que respalda un comportamiento uniforme de selección por tamaño en las proporciones analizadas.
La recuperación de marcadores de ADN a microescala se evaluó adicionalmente con proporciones de perlas de 0,6×, 0,9×, 1,2× y 1,8×. El lote analizado mostró recuperaciones medias de aproximadamente el 30,2 %, 58,4 %, 70,7 % y 86,9 %, respectivamente. La recuperación con las proporciones de 0,9×, 1,2× y 1,8× fue comparable a la del lote de control. La menor recuperación observada con 0,6× se atribuyó a pequeñas variaciones del volumen de elución bajo la condición de elución de 50 µl.
En la evaluación del fondo de ácidos nucleicos, las mediciones mediante Qubit se situaron por debajo del límite de detección para el lote de perlas A4 XP analizado, lo que indica que no se detectó fondo de ácidos nucleicos en las condiciones evaluadas.
Además, MagPure A4 XP se comparó con AMPure XP en procedimientos de purificación y selección por tamaño durante la preparación de bibliotecas, utilizando muestras combinadas de cfDNA. En los ensayos de selección de tamaño en una sola etapa, los lotes de MagPure A4 XP evaluados produjeron concentraciones medias de biblioteca de aproximadamente 7,99–8,32 ng/µl, frente a 6,35 ng/µl con AMPure XP en las condiciones analizadas.
En los ensayos de selección de tamaño en dos etapas, los lotes de MagPure A4 XP produjeron concentraciones medias de biblioteca de aproximadamente 3,15–3,72 ng/µl, comparables a los 3,39 ng/µl obtenidos con AMPure XP. La recuperación a microescala de un marcador de ADN de 50 pb también mostró valores elevados y comparables con proporciones de perlas de 1,2× y 1,5×; los lotes de MagPure A4 XP alcanzaron aproximadamente un 93–97 % de recuperación.
Estos resultados respaldan el uso de MagPure A4 XP en la purificación de productos de PCR, la purificación de bibliotecas y la selección por tamaño para NGS, en flujos de trabajo que requieren un rendimiento uniforme de las perlas, una recuperación controlada de fragmentos y compatibilidad con procedimientos similares a los utilizados con AMPure XP.
Kit Contents
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Contents
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BP-5
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BP-50
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BP-500
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MagPure A4 XP
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5 ml
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50 ml
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500 ml
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Storage and Stability
MagPure A4 XP should be stored at 2-8°C upon arrival and is stable up to 18 months under the condition. However, short-term storage (up to 4 weeks) at room temperature (15-25°C) does not affect its performance. — Shake the reagent well before use. It should appear homogenous and consistent in color.
DO NOT FREEZE.