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La extracción de ARN vegetal suele verse dificultada por los polisacáridos, los polifenoles y las ARNasas activas, que pueden afectar a la integridad del ARN y a los análisis posteriores. Un flujo de trabajo eficaz requiere tanto la inactivación rápida de las ARNasas como la eliminación controlada de los compuestos inhibidores.
Los sistemas de extracción de ARN vegetal de Magen integran flujos de trabajo basados en columnas y perlas magnéticas para adaptarse a diferentes tipos de muestras vegetales y requisitos experimentales.
Para muestras vegetales complejas o variables, incluidos los tejidos ricos en polifenoles y polisacáridos, la lisis optimizada con guanidina combinada con protección antioxidante mejora la estabilidad del ARN y el control de los inhibidores. Un sistema representativo es HiPure Plant RNA Plus Kit (R4150), que utiliza un sistema de purificación de doble columna para mejorar la calidad del ARN destinado a aplicaciones transcriptómicas.
Para muestras difíciles o ricas en inhibidores con las que los métodos convencionales producen un rendimiento o una pureza insuficientes, pueden utilizarse flujos de trabajo basados en CTAB para mejorar la eliminación de impurezas. HiPure HP Plant RNA Mini Kit (R4165) representa este enfoque y combina lisis con CTAB, extracción orgánica y digestión con DNasa para mejorar la pureza del ARN.
Para tejidos vegetales de procesamiento rutinario, los flujos de trabajo simplificados basados en guanidina permiten una purificación eficiente del ARN para RT-PCR y análisis de expresión génica.
Los sistemas basados en perlas magnéticas permiten incorporar la extracción de ARN vegetal a flujos de trabajo automatizados y de alto rendimiento, manteniendo una recuperación uniforme entre las muestras.
Para tejidos de frutos o muestras ricas en almidón, los flujos de trabajo basados en fenol siguen siendo eficaces para el procesamiento de matrices difíciles.
Los laboratorios pueden seleccionar el flujo de trabajo adecuado según la composición de las muestras, el rendimiento de procesamiento requerido y las aplicaciones posteriores.
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